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Fechas de muestreo:

Resumen del Diseño del Estudio

Análisis

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Aquí puede seleccionar covariables para los modelos de ocupacia.

Nota: Las covariables numéricas y categóricas pueden ser incluidas.

Tabla de Selección de Modelos

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Modelo de Abundancia:

Royle-Nichols: Estima la abundancia a partir de datos de detección/no detección

Tabla de Selección de Modelos

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Instrucciones

Página Principal

Por defecto, la página principal mostrará un resumen de todos los proyectos de la iniciativa Paisajes Sostenibles de la Amazonia. Puede seleccionar cualquier proyecto de la iniciativa haciendo clic en el menú desplegable que se localiza debajo de Seleccione un proyecto . La página se actualizará en función de su selección y usted verá:

  • En la parte superior de la página: el nombre del sitio y el rango de fechas de muestreo.
  • En la parte izquierda de la pantalla, un resumen de:
    • Número total de especies
    • Número de especies de mamíferos y el de aves
    • Número total de imágenes de animales
    • Número de cámaras trampa
    • Número de días de cámaras trampa (el número de días que cada cámara estuvo activa, sumado para todas las cámaras en el proyecto), el cual representa el esfuerzo de muestreo.
  • En la parte derecha de la pantalla: un mapa de las ubicaciones de las cámaras del sitio.
  • En la parte derecha de la pantalla, debajo del mapa: pestañas para ver gráficos y tablas relacionados con el proyecto, incluyendo:
    • Riqueza: Gráfico de la riqueza de especies (el número de imágenes por animal). El color de la barra indica si la especie es un mamífero, un ave u otra.
    • Lista: Una lista completa de las especies fotografiadas, que se puede ordenar y buscar.
    • Curva de acumulación: Muestra el número de especies registradas a medida que se recolectan más datos, utilizando el estimador de números de Hill.
    • Abundancia relativa: Compara la tasa de detección (observaciones por 100 días-cámara) entre diferentes proyectos y periodos de tiempo.
    • Cronología de Implementación: Muestra la línea de tiempo para cada cámara trampa, desde su fecha de inicio hasta su fecha de finalización.

Página de análisis

Capas Espaciales (Opcional)

La pestaña Capas Espaciales le permite subir sus propios datos espaciales (actualmente archivos GeoTIFF) para utilizarlos como covariables en los modelos de ocupancia. El flujo de trabajo es el siguiente:

  • Use el gestor de 'Capas Espaciales' para subir un archivo .tif.
  • La aplicación extraerá automáticamente los valores del raster para cada ubicación de cámara y los mostrará en la pestaña 'Tabla de Covariables'.
  • Explore la distribución y correlación de sus covariables en las pestañas correspondientes.
  • Estas covariables estarán disponibles para la selección en el análisis de ocupancia en la pestaña 'Especies'.

Proyectos

Puede seleccionar y comparar fácilmente grupos dentro de un sitio haciendo clic en la pestaña Análisis de la barra de navegación superior. Una vez en la página, verá en la parte izquierda de la página, una sección con pestañas para seleccionar Proyectos o Especies. En la pestaña Proyectos puede seleccionar un proyecto y crear grupos para comparar siguiendo estos pasos:

  • Seleccione un proyecto en el menú desplegable.
  • Seleccione cómo desea crear los grupos:
    • Dibujando un polígono en el mapa. Si esta opción está seleccionada, puede crear grupos de comparación dibujando límites en el mapa de la parte derecha de la pantalla. El mapa muestra todas las ubicaciones de las cámaras en el sitio. Seleccione el ícono de polígono o el ícono de cuadrado para dibujar los límites alrededor de las ubicaciones que desee incluir en un grupo. Una vez completada la selección, vuelva a la parte izquierda de la pantalla y Añada un nombre al grupo . A continuación, haga clic en Guarde este grupo . Puede crear hasta cinco grupos siguiendo los mismos pasos.
    • Subiendo un archivo GeoJSON con grupos preseleccionados. Esta opción es conveniente para quienes tienen grupos separados y tienen la información almacenada en un archivo GeoJSON. El archivo GeoJSON debe incluir un campo con los IDs de las cámaras (titulado deployment_id ) y al menos un campo adicional con el nombre del grupo. La aplicación le permitirá seleccionar qué columna usar para la agrupación.
  • Una vez que haya terminado de crear los grupos, haga clic en Analizar para generar los análisis.
  • Haga clic en Borrar para eliminar los grupos y empezar de nuevo el análisis.

Análisis de proyectos

Debajo del mapa, verá tres pestañas con análisis de proyectos que comparan los grupos que ha creado:

  • Riqueza observada: este gráfico compara el número de especies observadas en cada cámara, separadas por grupo. Cada punto representa un muestreo de una cámara y el tamaño del punto indica cuántas imágenes se tomaron en esa ubicación. El punto más alto en el gráfico significa que se registraron más especies con respecto a un punto más bajo en el gráfico. Las áreas coloreadas representan el número medio de especies previstas para el grupo y la distribución estadística de las observaciones.
  • Curva de rarefacción: este gráfico muestra el número de especies registradas como factor del número de observaciones recolectadas, por grupo. La línea de puntos representa la tendencia observada, mientras que la línea sólida de la curva representa la tendencia esperada si se recolectan más observaciones, estimada a partir de números de Hill.
  • Tasa de detección: este gráfico muestra la tasa de detección media en todo el proyecto, comparada por grupos. La tasa de detección es el número de observaciones de animales por cada 100 días de muestreo. Cada punto representa una cámara y el tamaño del punto representa el número de observaciones en esa ubicación. El recuadro de color muestra la tasa de detección prevista entre el 25 y el 75% de los datos. La línea continua dentro del recuadro de color indica la tasa de detección media.
  • Wildlife Picture Index (WPI): Este análisis avanzado mide el cambio general en la comunidad de vida silvestre a lo largo del tiempo, que combina las tendencias de ocupancia de múltiples especies en un único indicador.
    • Inicio: Debe seleccionar al menos dos períodos de tiempo específicos (por ejemplo, 2015, 2016) en el panel izquierdo para habilitar este análisis. Una vez ejecutado, el análisis producirá varios resultados en diferentes pestañas:
    • Resumen por Especie: Una tabla que muestra las estadísticas de ocupancia para cada especie incluida en el análisis, permitiéndole ver qué especies están aumentando o disminuyendo.
    • Trayectorias de Ocupancia: Un gráfico que muestra la tendencia de ocupancia individual para cada especie a lo largo del tiempo.
    • Índice WPI Relativo: El gráfico principal del WPI. Muestra la tendencia general de la comunidad de vida silvestre. Un valor de 1.0 representa la línea base (el primer año). Valores por encima de 1.0 indican un aumento promedio en la ocupancia, mientras que valores por debajo de 1.0 indican una disminución.

Análisis de especies

La pestaña Especies le permite realizar análisis detallados para una especie específica, utilizando los grupos de comparación definidos en la pestaña Proyectos.

  • Seleccione una especie en el menú desplegable. El mapa se actualizará automáticamente para mostrar las ubicaciones de las cámaras donde se detectó esa especie. Un punto más grande indica un mayor número de observaciones.
  • Para acceder a los análisis de Actividad, Tasa de Detección, Ocupancia y Abundancia, primero debe preparar los datos. Defina el período de muestreo y la duración de las ocasiones, y luego haga clic en el botón Crear/Actualizar Historias de Detección . Esto procesará los datos para los análisis cuantitativos:
  • Actividad: muestra cuándo estuvo activa la especie durante el día. El gráfico puede leerse como un reloj: la parte superior del círculo es la medianoche, y la parte inferior del círculo son las 12:00 de la tarde. Los espacios se colorearán a las horas en que se detectó la especie. Cuando los colores están más cerca del exterior del círculo, significa que la especie se detectó más a menudo durante esa hora del día.
  • Tasa de detección: este gráfico muestra la tasa media de detección de la especie, comparada por grupos. La tasa de detección es el número de observaciones de esa especie por cada 100 días de muestreo. Cada punto representa la ubicación de una cámara y el tamaño del punto representa el número de observaciones en esa ubicación. El recuadro de color muestra la tasa de detección prevista entre el 25 y el 75%. La línea continua dentro del recuadro de color indica la tasa de detección media.
  • Ocupancia: esta pestaña le guía a través del proceso de modelado de ocupancia. Este análisis estima la probabilidad de que un sitio esté ocupado por una especie, teniendo en cuenta que la especie podría no ser detectada incluso si está presente. El flujo de trabajo es el siguiente:
    • Preparar los Datos de Detección: Como se mencionó anteriormente, este es el primer paso obligatorio para habilitar el análisis de ocupancia.
    • Revisar los Datos: Vaya a las pestañas Distribución de Detecciones y Resumen de Historias de Detección para verificar que los datos se han procesado correctamente. Un buen modelo requiere suficientes detecciones.
    • Ajustar y Seleccionar Modelos: En la pestaña Ajuste y Selección de Modelos, seleccione las covariables que desea probar (incluyendo los grupos que creó y las capas espaciales que subió). Haga clic en Ajustar modelos de ocupancia. La aplicación ajustará varios modelos y los clasificará por su valor de AICc en la tabla, ayudándole a identificar el modelo con mejor ajuste.
    • Visualizar la Ocupancia: La pestaña Gráfico de Ocupancia mostrará las estimaciones del mejor modelo para cada grupo. Esto incluye la probabilidad estimada de ocupancia y sus intervalos de confianza, junto con la proporción de detección observada.
    • Explorar el Mapa de Ocupancia: Una vez ajustados los modelos, aparecerá un mapa de ocupancia que muestra la probabilidad de ocupancia predicha para cada ubicación de cámara.
  • Abundancia: esta sección le guía a través del proceso de modelos de abundancia por especie. Le permite analizar la abundancia observada de la especie seleccionada, teniendo en cuenta que la especie podría no ser detectada incluso si está presente. El flujo de trabajo es el siguiente:
    • Preparar los Datos de Detección: Como se mencionó anteriormente, este es el primer paso obligatorio para habilitar el análisis de abundancia.
    • Revisar los Datos: Vaya a las pestañas Distribución de Detecciones y Resumen de Historias de Detección para verificar que los datos se han procesado correctamente. Un buen modelo requiere suficientes detecciones.
    • Ajustar y Seleccionar Modelos: En la pestaña Ajuste y Selección de Modelos, seleccione las covariables que desea probar (incluyendo los grupos que creó y las capas espaciales que subió). Haga clic en Ajustar modelos de abundancia. La aplicación ajustará varios modelos y los clasificará por su valor de AICc en la tabla, ayudándole a identificar el modelo con mejor ajuste.
    • Visualizar la Abundancia: La pestaña Gráfico de Abundancia mostrará las estimaciones del mejor modelo para cada grupo. Esto incluye la probabilidad estimada de abundancia y sus intervalos de confianza, junto con la proporción de detección observada.
    • Explorar el Mapa de Abundancia: Una vez ajustados los modelos, aparecerá un mapa de abundancia que muestra la probabilidad de abundancia predicha para cada ubicación de cámara.